W roku 1975 Polska otrzymała gwarantowany przez rząd RFN kredyt w wysokości 1 mld marek. W kołach finansowych kredyt ten uzyskał potoczną nazwę “Jumbo”. W wyniku pogarszającej się sytuacji gospodarczej Polska miała kłopoty w obsłudze zadłużenia zagranicznego, w tym również kredytu “Jumbo”.

Początkiem nowego rozdziału w stosunkach polsko-niemieckich stała się wizyta w Polsce kanclerza federalnego Helmuta Kohla w listopadzie 1989 roku na zaproszenie premiera Tadeusza Mazowieckiego. W wydanym Wspólnym Oświadczeniu obaj mężowie stanu zapowiedzieli powstanie funduszu, który miał wspierać projekty będące przedmiotem wspólnego zainteresowania. W międzyrządowej Umowie z 7 listopada 1990 roku o kredycie finansowym z 1975 roku, strona niemiecka umorzyła stronie polskiej większość zaległych zobowiązań płatniczych, a pozostałe zobowiązania w wysokości 570 mln DM miały być spłacane w złotych polskich i przekazywane na fundusz finansowania w Polsce projektów, stanowiących przedmiot wspólnego zainteresowania.

Fundusz “Jumbo” objęła powołana w październiku 1991 roku Fundacja Współpracy Polsko-Niemieckiej, zarejestrowana w Warszawie i działająca na zasadach prawa polskiego. 11 grudnia 1991 roku ukonstytuował się Zarząd Fundacji, którego skład ustaliły odpowiednio rządy RP i RFN. Skład Zarządu zmieniał się w latach 1993-2003 siedmiokrotnie.

W lecie 2000 roku Fundacja prezentowała swoją działalność w Pawilonie Polskim na Światowej Wystawie EXPO 2000 w Hanowerze, a w październiku 2000 roku na własnym stoisku na Międzynarodowych Targach Książki we Frankfurcie nad Menem, na których Polska wystąpiła w charakterze gościa honorowego.

Do 2001 roku FWPN dofinansowała ponad 4600 projektów. Większość środków finansowych została wydana w Polsce.

Od 2001 roku, z uwagi na malejące środki finansowe, zrezygnowano z dofinansowywania projektów inwestycyjnych i ograniczono wysokość przyznawanych dotacji do 50 tys. złotych. W 2002 roku, w związku z koniecznością zmiany profilu Fundacji, zmianie uległ jej Statut. Na mocy nowego Statutu w 2003 roku została powołana Rada Fundacji.